清军阵亡521人，伤150人，下落不明者51人，军舰被击沉9艘，伤2艘，被毁兵船十余艘。
此役中，詹天佑的同学，我国派出的首批留美幼童中的四名阵亡，其中三名是麻省理工学院毕业后在福建水师服役。
马江海战之后，朝廷命建昭忠祠，中祀栗主12，东西配飨各24人，均舰上弁目及练童、医生等，两庑祀阵亡兵士736人，船政大臣裴荫森制文立碑，以慰忠魂而垂不朽。
阵亡将士姓名附下：
“飞云”督带总兵衔准补广东平海营参将高腾云
“福胜”、“建胜”督带兰翎参将衔补用游击尽先都司吕瀚
“福星”管驾都司衔五品军功陈英
“振威”管驾都司衔留闽尽先守备许寿山
“福胜”管驾都司衔留闽补用守备尽先千总叶琛
“建胜”管驾都司衔五品军功林森林
“扬武”兵船副管驾花翎都司衔升用守备尽先千总梁梓芳
平海左营三号师船管驾蓝翎留闽尽先补用都司蔡福安
平海左营一号师船管驾蓝翎尽先补用都司蔡接
平海左营四号师船管驾蓝翎尽先补用守备张启
镇海右营渔船管驾闽浙督标守备衔尽先千总李来生
闽四师船管驾闽安左营千总陈猛
“建威”大副六品军功陈善元
“飞云”大副六品军功尽先拔补外委谢润德
“建胜”大副六品军功补用把总丁兆中
“振威”大副六品军功梁祖勋
“扬武”二副五品军功林鹏
“福星”二副六品军功张春
“振威”二副六品军功邝咏钟
“飞云”正管轮五品军功潘锡基
“振威”正管轮都司衔水师提标尽先守备林维三
“福胜”正管轮七品军功任三穆
“建胜”正管轮五品军功陆崇业
“福星”副管轮五品军功补用把总尽先外委陈士秀
“福胜”副管轮七品军功戴庆涛
“建胜”副管轮六品军功从九职衔郑守三
“扬武”三管轮七品军功庞廷桢
“振威”三副五品军功邱芳泉
“济安”医生吴进阶
“建胜”学习管轮学生陈锦超
“济安”管炮六品军功梁琛
宁船三号队长黄得才
宁船三号队长黄有福
宁船三号队目王益年
平海左营一号师船司事五品蓝翎侯选州吏目林荣光
平海左营二号师船司事五品军功尽先外委广东平连
学武生胡定魁
平海左营四号师船司事尽先都司倪竹虚
宁船三号总头目长乐学武生郑景涛
“扬武”正管队五品军功郑葆辰
“扬武”副管队蓝翎闽浙督标水师尽先补用守备郭玉麟
“扬武”管炮正头目六品军功张涌泉
“扬武”留美回国练生六品军功杨兆楠
“扬武”留美回国练生六品军功薛有福
“扬武”留美回国练生七品军功黄季良
“飞云”三管轮五品军功马应波
“福星”三副五品军功王涟
“福星”三管轮六品军功陈常筹
“福胜”大副五品军功翁守正（原名守恭）
“建胜”管炮六品军功江鸿珍
“扬武”水手正头目余怀
“扬武”水手副头目杨保
“飞云”水手头目六品军功刘就
“福星”水手头目黄良庆
“福胜”水手头目杨昌胜
“福胜”升火头目任阿焕
“建胜”升火头目郑德春
福靖老后营差弁花翎游击衔尽先补用都司胡鸟式翼
看管坞口差弁世袭云骑尉候选守备陈俊
“建胜”炮船升火从九职衔李绍芬
“扬武”水手副头目杨宝
“扬武”练生杨绍广
平海左营一号师船炮手五品军功从九职衔蔡五埙
平海左营一号炮手六品军功张林
平海左营一号炮手尽先把总殷明恒
“扬武”
管水缸林奇山，管水汽表陈仁图，号手吴进福，鼓手黄扶，舵工邱济、陈裘、陈三、陈承、欧模、孟长雅，水手洪来、林鼎、林俦、朱必、洪集、吴聘、陈胜、林金钊、翁从、黄化、李灿、林实、林魁、黄安、庞翰、吴百达、郭灶、何洪宽、林长安、邱永丰、徐发、洪同，炮勇周世源、张祝、谢恒升