数万亿纪元前，一对男女突然来到这个即将湮灭的小宇宙，两人施展大神通，将小宇宙从新改造，并将其分隔成了九个相连的世界，这就是后世广为相传的九界。
时光流转，在两人的有意无意中，世间出现了万物生灵，各种生灵循着正常或异常的道路，在九大世界中自然进化。
世间万物，除了飞禽走兽外，出现了被称之为万灵之长的拥有智慧与情感的物种，这种物种极为接近创世之圣神，但随着九大世界各自进化道路的不同，这些物种又分成了数百种不同的种族。
随着进化的程度不同，种族的能力大小也不同，这些不同的种族为各种利益相互攻伐。经过数亿年后，数百种族消失殆尽，只剩下一些超级强势的种族延续至今。
其中神族，魔族，鬼族，龙族，血族，人族，天使族，精灵族，矮人族，泰坦族，兽族，妖族，海族的数量和势力都无比强大，他们霸着九界，相互制约。
千万年后，九道流光从创世圣山中飞出，分别注入九个世界中去，这九道流光就是后世称之为创世晶石的神晶。
得到九个神晶的九个种族，进化道路得到改善，生命力更为强大，各种武技魔法技术也日益精进，逐渐走向了繁荣昌盛，成为了九大世界的霸主。
因霸主种族的出现，九界因此得名，后世称之为神界、鬼界、妖界、魔界、人界、灵界、圣界、幻界、无界。
各大霸主种族都不满足于现状，因此每隔数百年都会爆发世界大战。
亿万年后，无界突然出现一场原因不明的爆炸，整个无界都陷入了一片灾难，无界的神晶也因此落入人界。
各界霸主种族的首领连同精英族人纷纷前往无界调查真相，在献出无比惨重的代价后，无名爆炸事件得以平息，各族之间对此守口如瓶，他们约定不能将残酷的真相告知世人，每一代首领只能让一个人保留这个与创世之圣神有关的秘密真相。
但创世之圣神所遗留下的三本书内记载了秘密真相，为了防止真相外泄，各族首领将三书各分上中下三卷，分别藏于九大世界各地。
为向世人解释，各族将无名爆炸事件称之为神魔大战。
同时九大神晶只要有一块受损，这个世界将会毁灭的传说开始流传。
然后，无界入口被超级圣结界封印，同时无界内出现与世隔离的失落之都。
随着时光的流逝，数百万年后的某年，各霸主种族首领尽皆因不明原因暴毙，秘密真相终至失传，三书所藏位置也不为人知。
如今，历经数万纪元遗失真相的沧海桑田，历史的残酷真相却将被再次揭开，而命运的目光却停留在一个少年身上。